مسجد امام علی در اردبیل و بلوار دانشگاه واقع شده است. و از نظر موقعیت جغرافیایی در نزدیکی موزه تاریخ طبیعی اردبیل و همچنین دانشگاه محقق اردبیلی، مرکز بهداشت شهید باکری شماره 10، موزه تاریخ علوم اردبیل، سالن تربیت بدنی پیام نور واحد اردبیل و دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی قرار گرفته است.