مجتمع پزشکی بقیه الله در محله آفاران اصفهان و خیابان مرتضی گرجی (4) واقع شده است. و از نظر موقعیت جغرافیایی در نزدیکی بازارچه مسجد شفیعی و همچنین دروازه تهران، کلانتری 12 جمهوری اسلامی، داروخانه شبانه روزی دکتر سیادت موسوی، نوساز محاسب صفاهان و فست فود شاندرمن قرار گرفته است.