مسجد حاج طاهر شیرازی در محله کوی کلانتریان دزفول و خیابان آقاگپی زارع (علم عباس) واقع شده است. این مکان یکی از هفده مسجد در محله کوی کلانتریان دزفول میباشد و از نظر موقعیت جغرافیایی در نزدیکی مراکز مهمی مانند خانه تاریخی سوزنگر و مرکز تجاری مجدی نسب و همچنین عمارت تاریخی قطب، بیمه ایران، بقعه شاه رکن الدین، مسجد حصیر بافان و سیسمونی نباتی قرار گرفته است.