مسجد فاطمه الزهرا (س) در محله باغ نی کرمانشاه و خیابان فرعی اول واقع شده است. این مکان یکی از دو مسجد در محله باغ نی کرمانشاه میباشد و از نظر موقعیت جغرافیایی در نزدیکی رستوران لاله، مرکز انتقال خون کرمانشاه، کتابخانه شهید بهشتی، بیمه ایران نمایندگی رضایی و دفتر اسناد رسمی ۲۵ کرمانشاه قرار گرفته است.