مسجد فاطمه الزهرا سلام الله علیها در خراسان رضوی، شهرستان سرخس و خیابان بیست متری دوم فرهنگیان واقع شده است. و از نظر موقعیت جغرافیایی در نزدیکی بیمارستان لقمان حکیم و همچنین چلو کبابی میرزا، هنرستان فنی شهید کلانتری سرخس و کارگاه صنایع فلزی قرار گرفته است.