مسجد حاج محمد حسین در محله قطب آباد اردکان و بلوار آیت الله خامنه ای واقع شده است. این مکان یکی از چهار مسجد در محله قطب آباد اردکان میباشد و از نظر موقعیت جغرافیایی در نزدیکی مراکز مهمی مانند موزه مفاخر اردکان (خانه آیت الله خاتمی) و بازار چارسوق و همچنین بافت تاریخی اردکان، حسینیه کوشکنو، موزه مردم شناسی اردکان، ساندویچی و مسجد جامع اردکان قرار گرفته است.