مسجد شیخ یوسف در محله شیخ یوسف اصفهان و خیابان شهید مصطفی آقاتهرانی واقع شده است. این مکان یکی از دو مسجد در محله شیخ یوسف اصفهان میباشد و از نظر موقعیت جغرافیایی در نزدیکی دوچرخه آباریس اصفهان و همچنین بوتیک هتل عمارت سهروردی ، پارچه عادل، Narcis B&B، نمایندگی پکیج سونیه دوال و چایخانه یاران قرار گرفته است.